《我的鄰居姐姐》第三季的情節圍繞著主角小冬和他的鄰居姐姐小雅展開，展示了他們在青春成長中的點滴故事。這一季不僅延續了前兩季的輕松幽默，也增添了許多感人的回憶和關于成長的思考。
故事開始的時候，小冬剛剛經歷了高中的期末考試，內心滿是對未來的迷茫。盡管他的學習成績尚可，但還是沒有找到自己真正的興趣所在。這時，小雅則已經進入了大學，正在經歷新的挑戰和機遇。她常常回來和小冬分享在大學生活中的趣事，幫助他開闊眼界。
某個晴朗的周末，小冬受到小雅的邀請，一起去參加大學的迎新晚會。小冬雖然有些緊張，但還是勇敢地答應了。他想借此機會，看看姐姐的大學生活，也希望能從中找到一些未來的方向。當晚的晚會上，小雅如同耀眼的明星，吸引了周圍眾多的目光。小冬站在一旁，感到有些自卑和不安。
在晚會上，小雅牽著小冬的手，鼓勵他和其他同學交流。初始的小冬很拘謹，但在小雅的引導下，他慢慢放開了自己。在一個游戲環節中，小冬和一位學姐搭檔，面對面交換信息，那種興奮與緊張交織的感覺讓小冬瞬間忘記了自己的顧慮，展現出自己的幽默和才華，得到了其他同學的認可。
隨著時間的推移，小冬逐漸融入了大學的氛圍，并受到靈感的啟發，他開始考慮自己想參與的領域。在小雅的鼓勵下，他決定嘗試加入一個音樂社團。小冬從小就喜歡音樂，但由于缺乏自信，一直沒有表現出來。在社團的排練中，他開始逐漸放下包袱，開始展現自己的才華。
然而，隨著小冬的成長，他和小雅之間的關系也開始發生微妙的變化。小冬發現自己不僅僅是將小雅視為姐姐，更多的是對她的依賴和情感，這讓他感到困惑和不安。他不知道自己是否應該向小雅表白那種情感，還是保持現有的關系。
就在小冬煩惱的時候，小雅無意中提起，自己在學習和生活中也有過類似的困惑，尤其是面對友情與愛情之間的抉擇。她告訴小冬，曾經也有一個男生對她產生好感，但最終因為彼此的關系而選擇了放棄。小冬聽后心里一震，原來小雅也有過這樣的困惑，這讓他感到自己并不是孤獨的。
事情的發展并沒有如小冬所期待的那樣簡單。就在他鼓起勇氣決心向小雅表白時，小雅卻收到了來自某位學長的告白。面對這一切，小冬感到無比失落和沮喪，仿佛整個世界都在瞬間崩潰。小雅對這位學長的欣賞和接受讓小冬難以自掘自封，卻也開始反思自己的感情到底是什么。
整整一個星期，小冬都處于低落的狀態。他開始疑惑自己和小雅的友情是否還會持續，以及自己該如何面對這一切。就在這個時候，小雅卻注意到了小冬的變化，逐漸意識到他的異常。作為姐姐的她，不僅想幫助小冬，更希望能打破彼此間的隔閡。
在一次私下的交談中，小雅主動詢問小冬的心情，鼓勵他勇敢表達自己的感受。小冬終于忍不住，向小雅傾訴了自己對她的感情與困惑。小雅聽后沒有表現出意外，反而露出了一個理解的微笑，她告訴小冬，自己一直把他當做最好的朋友，彼此的關系是他所珍惜的，不希望因為情感的變化而影響到這份珍貴的情誼。
小冬雖然依然有些失落，但也漸漸明白，人與人之間的感情是錯綜復雜的，有時候友情比愛情更為珍貴。小雅和小冬在這一過程中的溝通使得彼此之間的關系更加深厚，盡管小冬內心依舊對小雅抱有一絲期待，但他也學會了欣賞和尊重小雅的選擇。
隨著學期的結束，小冬成功進入了音樂社團，并在各類活動中嶄露頭角。他的快樂與成就感讓他逐漸從對小雅的情感中走出，開始更加關注自己的未來和夢想。而小雅則繼續她的大學生活，支持小冬的同時，也在自己的路上不斷前行。
這一季的結束并不是終點，而是新旅程的開始。小冬和小雅的故事告訴我們，成長的過程中，情感的變化在所難免，但彼此之間的理解和支持才是最可貴的。無論未來走向何方，他們都將是彼此人生旅途中的重要存在。